Για πολλά χρόνια η κολπική μαρμαρυγή θεωρούνταν μία αβλαβής διαταραχή. Εν τούτοις, τώρα είναι γνωστό ότι η κολπική μαρμαρυγή μπορεί να προκαλέσει μελλοντικά προβλήματα. 

Σε ορισμένες περιπτώσεις είναι δυνατόν να εγκατασταθεί η κολπική μαρμαρυγή με υψηλή συχνότητα, μη ανεκτή από τον οργανισμό του ασθενή με εικόνα οξέος πνευμονικού οιδήματος ή με λιποθυμία. Όμως η σοβαρότερη επιπλοκή της κολπικής μαρμαρυγής είναι το εμβολικής αιτιολογίας αγγειακό εγκεφαλικό επεισόδιο το οποίο, πέραν του ότι απειλεί άμεσα τη ζωή του ασθενούς, αφήνει χρόνια αναπηρία, επηρεάζοντας την ποιότητα ζωής του αρρώστου. 

Αν και πολλοί άνθρωποι ζουν για χρόνια με κολπική μαρμαρυγή χωρίς προβλήματα, η χρόνια κολπική μαρμαρυγή χωρίς θεραπεία συνοδεύεται από αύξηση του κινδύνου για θάνατο.