Ο σκοπός της θεραπείας της κολπικής μαρμαρυγής είναι: 

• να επανέλθει ο φυσιολογικός καρδιακός ρυθμός (φλεβοκομβικός). 
• να επιτευχθεί έλεγχος της καρδιακής συχνότητας. 
• να ελεγχθούν τα όποια συμπτώματα
• να προληφθεί η δημιουργία θρόμβων και η εκδήλωση εγκεφαλικού επεισοδίου.